• 1920-1945 Thành lập với tên gọi ŠK Skalica
• 1945-1953 Đổi tên thành Sokol Tekla Skalica
• 1953-1963 Đổi tên thành DŠO Tatran Skalica
• 1963-1990 Đổi tên thành TJ ZVL Skalica
• 1990-2006 Đổi tên thành Športový klub ŠK Skalica
• 2006-nay Đổi tên thành MFK Skalica[1]

Thăng hạng Fortuna Liga

MFK Skalica lên được Fortuna Liga mặc dù thất bại 0-2 trước MFK Zemplín Michalovce trong trận đấu cuối cùng của DOXXbet liga ngày 13 tháng 6 năm 2015 và đội bóng làm bất ngờ mọi người khi về đích thứ 2 và có lần đầu tiên trong lịch sử lên chơi ở giải bóng đá cao nhất Slovakia cũng như MFK Zemplín Michalovce.